Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN1Q04323 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms