Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms