Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms