Protein–RNA interactions for Protein: P78329

CYP4F2, Phylloquinone omega-hydroxylase CYP4F2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F2P78329 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F2P78329 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms