Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms