Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VBP1P61758 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VBP1P61758 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VBP1P61758 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VBP1P61758 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VBP1P61758 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VBP1P61758 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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VBP1P61758 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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VBP1P61758 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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VBP1P61758 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VBP1P61758 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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VBP1P61758 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VBP1P61758 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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VBP1P61758 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VBP1P61758 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VBP1P61758 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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VBP1P61758 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VBP1P61758 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VBP1P61758 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VBP1P61758 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VBP1P61758 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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VBP1P61758 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VBP1P61758 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VBP1P61758 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VBP1P61758 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VBP1P61758 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VBP1P61758 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VBP1P61758 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VBP1P61758 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VBP1P61758 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VBP1P61758 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VBP1P61758 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VBP1P61758 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VBP1P61758 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VBP1P61758 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VBP1P61758 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VBP1P61758 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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