Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSX2P58304 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VSX2P58304 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VSX2P58304 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VSX2P58304 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VSX2P58304 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VSX2P58304 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
VSX2P58304 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
VSX2P58304 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VSX2P58304 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VSX2P58304 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VSX2P58304 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VSX2P58304 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSX2P58304 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms