Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms