Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A2P55011 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms