Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PGGT1BP53609 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PGGT1BP53609 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PGGT1BP53609 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PGGT1BP53609 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PGGT1BP53609 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PGGT1BP53609 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PGGT1BP53609 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PGGT1BP53609 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PGGT1BP53609 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PGGT1BP53609 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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