Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms