Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSOP43234 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSOP43234 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSOP43234 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSOP43234 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSOP43234 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSOP43234 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSOP43234 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSOP43234 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSOP43234 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSOP43234 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSOP43234 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSOP43234 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSOP43234 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSOP43234 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSOP43234 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSOP43234 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSOP43234 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSOP43234 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSOP43234 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSOP43234 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSOP43234 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms