Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIA2P42262 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms