Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms