Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms