Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms