Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
APCP25054 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCP25054 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
APCP25054 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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