Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms