Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB2P22676 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB2P22676 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB2P22676 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB2P22676 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB2P22676 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALB2P22676 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALB2P22676 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALB2P22676 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALB2P22676 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALB2P22676 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALB2P22676 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALB2P22676 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALB2P22676 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CALB2P22676 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALB2P22676 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALB2P22676 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALB2P22676 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALB2P22676 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALB2P22676 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALB2P22676 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CALB2P22676 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALB2P22676 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALB2P22676 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms