Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HPGDP15428 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HPGDP15428 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HPGDP15428 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HPGDP15428 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HPGDP15428 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HPGDP15428 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HPGDP15428 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HPGDP15428 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HPGDP15428 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HPGDP15428 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HPGDP15428 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HPGDP15428 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HPGDP15428 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HPGDP15428 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HPGDP15428 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HPGDP15428 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms