Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT3P12035 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT3P12035 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT3P12035 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT3P12035 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT3P12035 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT3P12035 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT3P12035 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT3P12035 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT3P12035 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT3P12035 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT3P12035 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT3P12035 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT3P12035 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT3P12035 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT3P12035 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT3P12035 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT3P12035 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT3P12035 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT3P12035 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT3P12035 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT3P12035 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT3P12035 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT3P12035 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT3P12035 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT3P12035 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT3P12035 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT3P12035 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms