Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB1P08034 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB1P08034 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB1P08034 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB1P08034 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB1P08034 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB1P08034 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB1P08034 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB1P08034 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB1P08034 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB1P08034 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB1P08034 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB1P08034 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB1P08034 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB1P08034 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB1P08034 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB1P08034 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB1P08034 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB1P08034 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB1P08034 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB1P08034 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB1P08034 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB1P08034 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB1P08034 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB1P08034 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB1P08034 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB1P08034 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB1P08034 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB1P08034 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms