Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYNP07948 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYNP07948 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYNP07948 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYNP07948 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYNP07948 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYNP07948 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYNP07948 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYNP07948 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYNP07948 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYNP07948 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYNP07948 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYNP07948 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYNP07948 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYNP07948 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYNP07948 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYNP07948 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYNP07948 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYNP07948 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYNP07948 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYNP07948 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYNP07948 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYNP07948 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYNP07948 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYNP07948 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LYNP07948 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LYNP07948 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYNP07948 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYNP07948 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms