Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA10O75578 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms