Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms