Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms