Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms