Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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