Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms