Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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