Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms