Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms