Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATAD3AQ9NVI7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms