Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms