Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms