Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBEC3GQ9HC16 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms