Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COG4Q9H9E3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
COG4Q9H9E3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
COG4Q9H9E3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COG4Q9H9E3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COG4Q9H9E3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COG4Q9H9E3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COG4Q9H9E3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COG4Q9H9E3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
COG4Q9H9E3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COG4Q9H9E3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COG4Q9H9E3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COG4Q9H9E3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COG4Q9H9E3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COG4Q9H9E3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
COG4Q9H9E3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COG4Q9H9E3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
COG4Q9H9E3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
COG4Q9H9E3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COG4Q9H9E3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COG4Q9H9E3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COG4Q9H9E3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COG4Q9H9E3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COG4Q9H9E3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COG4Q9H9E3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COG4Q9H9E3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COG4Q9H9E3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.3 ms