Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRDM12Q9H4Q4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRDM12Q9H4Q4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms