Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms