Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM7Q9BQ49 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms