Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms