Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms