Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP4Q96DX8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms