Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX6

LRRC58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC58Q96CX6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC58Q96CX6 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms