Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms