Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYRIPQ8NFW9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms