Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms