Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SVOPQ8N4V2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms