Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms