Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms